在这一场惨烈的战争当中，没有真正的赢家。

美军遭受到了二战以来最大的重创，元气大伤，数以十万计的士兵伤亡，大量先进的武器装备被摧毁，一大批优秀的军官和军工专家被刺杀。美国的总体军事实力经此一役后大幅下降，综合国力也受到了严重的打击，自此一蹶不振。

兴日会和兴日会暴徒军队彻底覆灭了。其中，三万多名兴日会“死士”和兴日会成员或在战场上战死，或剖腹自尽，或药物中毒。还有超过一万名兴日会“死士”和兴日会成员被美军俘虏。

另外，作为另一股重要参战力量的日本自卫队，也同样是伤亡惨重，伤亡情况并不比美军好多少。有超过八万名官兵在这场战争中战亡。

而最凄惨的，是受到战火摧残的冲绳岛、东京、横须贺等城市，有大量的当地居民无辜丧生，城市被破坏得满目苍夷，原本繁华喧嚣的街区变成了一片片废墟，令人唏嘘不已。

至于战争的罪魁祸首，希尔，则被盖伦“杀死”了。希尔所创立的“宇宙教”的信徒们和“万物归道”计划的同伙，因盖伦供出了详尽的人员名单，而被各国政府通缉逮捕。希尔的极端势力就此土崩瓦解。

（萨钦.拉詹——拉吉的宿敌，也在这一场战争中，被美军特种部队击毙了。）

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战争结束后，动荡纷乱的状态仍持续了很长一段时间。不安与恐惧笼罩着世界的每一个角落，各种思想依旧激烈碰撞着，伤心哀痛的情绪弥漫不散。一直到了数个月之后，人们才开始渐渐适应这场战争所带来的冲击，生活才开始慢慢恢复平静。

故事的主角——伊藤、拉吉、盖伦，也迎来了各自的新生活。

伊藤和拉吉，本来是被美国政府软禁着的。因为美国政府想要逼迫他们配合，进一步研究虫洞传输技术和特殊基因移植技术，并有意将这两项技术用于军事用途，来保持美国军事实力在世界上的绝对优势，以维护其霸权地位。但由于世界各国的民众都在这场战争中亲眼目睹了虫洞武器和“新型人类”士兵的恐怖威力，对这两项“兵器”充满了恐惧，尤其是美国和日本的国内民众更是亲身经历了这场浩劫，遭受到了这两项“兵器”所带来的不可磨灭的创伤，对这两项“兵器”有着极深的心理阴影，因此，不管是美国国内的民众，还是日本民众，还是其他国家的民众，都一致反对将这两项技术用于军事用途，纷纷以游行示威、联名抗议、集体游说、舆论谴责等方式，表达自己的不满，极力阻扰美国政府的恶劣企图。就这样，在国内和国外的重重施压下，美国政府不得不顺应民意，对外声明将会放弃所有与这两项技术相关的军事研发计划，并与各国一起致力于推动这两项技术的商业化应用，以促进交通、能源、通讯、太空探索、医疗等诸多领域的发展。同时，也不再以各种名义设法软禁伊藤和拉吉，让伊藤和拉吉恢复了自由，以免被人们诟病。